A pesquisa científica e tecnológica é parte integrante de um sistema de inovação. A CERTI dispõem em seu quadro de colaboradores, doutores, mestres, especialistas e graduados em diferentes áreas tecnológicas. Para atender os desafios em inovação demandados pelo mercado onde o conhecimento deve gerar novos produtos e serviços inovadores no menor prazo possível, exigindo competências multidisciplinares com alto nível de especialização, pode ser necessário a utilização de conhecimento que não é dominado pela instituição e que precisa ser obtido ou desenvolvido por pesquisadores que exercem a pesquisa básica no seu dia-a-dia.
Foi desenvolvido um modelo de relacionamento e de cooperação conjunto com universidades e outras instituições de pesquisas no âmbito nacional e internacional que fortalecem o processo de inovação gerido pela CERTI. Esta iniciativa melhora os resultados dos projetos, permitem uma constante transferência de conhecimento entre universidades, CERTI e empresas, e contribuem para que a pesquisa científica e tecnológica seja consequentemente aplicada no mercado.
Dentre as instituições de pesquisa, destaca-se a forte relação com a Universidade Federal de Santa Catarina – UFSC e o Massachusetts Institute of Technology – MIT, por meio do programa Industrial Liaison Program – ILP.
